Beschrijving van het project
- Titel van het project: OncoAI – a machine-learning framework to predict cancer cell vulnerability at the gene-regulatory level
- Selectiejaar: 2020
- Organisatie: KU Leuven
- Toegekend bedrag: 578 000 €
- Duurtijd financiering: 4 jaar
Technologische innovatie is een drijvende kracht achter kankeronderzoek. In het bijzonder voor de genetische analyse van tumoren ondergaat het veld een transformatie door het gebruik van DNA-sequenering die enorme hoeveelheden data genereren. Kankeronderzoek wordt “Big Data” onderzoek. Maar er is nog een andere revolutionaire technologie die enthousiast wordt onthaald in kankeronderzoek: single-cell genomica. Met robots en microfluidica (wetenschap van vloeistofbehandeling op microschaal) kunnen wij in ons labo het volledige transcriptoom (alle actieve genen) en het volledige epigenoom (alle controle-schakelaars) van een enkelvoudige cel bepalen, voor tienduizenden cellen gelijktijdig. De enorme uitdaging om therapie-resistente kankercellen te vinden en te karakteriseren komt hierdoor binnen handbereik. In dit project ontwikkelen we nieuwe artificiële intelligentie technieken om tienduizenden kankercellen te vergelijken, om nieuwe “cell toestanden” te ontdekken, en om de moleculaire schakelaars van elke toestand te bepalen. Onze methoden en software kunnen wereldwijd worden ingezet om dergelijke schakels te identificeren, en vervolgens nieuwe diagnostische en therapeutische strategieën te ontwikkelen.
