Beschrijving van het project
- Projecttitel: Tracking cfDNA origin during therapy in barcoded cancer models
- Selectiejaar: 2024
- Organisatie(s): Universiteit Gent
- Toegekend bedrag: 430 368 €
- Onderzoekcategorie: Fundamental Cancer research
- Financieringstermijn: 4 jaar
Circulerend (cel-vrij) DNA en RNA (cfDNA/cfRNA) moleculen in het bloed zijn de laatste jaren uitgegroeid tot waardevolle biomerkers voor precisie oncologie (gepersonaliseerde behandeling op basis van de genetische samenstelling van de patiënt). Nochtans blijven een aantal vragen in dit onderzoeksveld onbeantwoord. Daarom willen we met dit project te weten komen welke cellen in de tumor bijdragen aan de nucleïnezuren die we terugvinden in het bloed en de specifieke locatie van deze cellen in de tumor bepalen. Hiertoe gaan we enkele technologische en computationele ontwikkelingen doorvoeren die toelaten om de (ruimtelijke) oorsprong van cfDNA/cfRNA in het bloed te achterhalen. Daarnaast gaan we de dynamiek van de nucleïnezuren die in het bloed zijn vrijgesteld volgen. Meerbepaald gaan we hiervoor een “spatial transcriptomics” techniek (meting van genexpressie gecombineerd met genlokalisatie) aanwenden en gebruik maken van muismodellen met genetische gecodeerde tumoren. Nieuwe kennis die we zullen verwerven via dit project zal cruciaal zijn voor een verbeterde optimalisatie en interpretatie van vloeibare-biopt testen in de context van therapie-resistentie monitoring.
